Artikel ini berisi panduan dan berkas Skill AI yang dirancang khusus untuk Hermes Agent. Dengan memasang skill ini, Hermes Agent akan memiliki kapabilitas tingkat lanjut (smart research agent) dalam mengelola, menganalisis, serta memetakan literatur ilmiah secara otomatis untuk keperluan penyusunan proposal penelitian (Bab 1, Bab 2, Bab 3, dst.).
Prasyarat (Minimum Requirement): Sebelum mengeksekusi skill ini, pastikan pengguna telah memiliki:
- Pemahaman mendalam mengenai GAP Penelitian (Research Gap) serta Judul Penelitian yang jelas.
- Seluruh berkas jurnal/paper referensi berbasis PDF yang telah dikumpulkan ke dalam satu folder utuh.
Di bawah ini adalah kode konfigurasi YAML untuk skill auto-research-workflow-v2. Anda dapat menyalin (copy) seluruh blok kode di bawah ini dan menyimpannya sebagai berkas skill pada Hermes Agent Anda.
---
name: auto-research-workflow-v2
description: Otomatisasi manajemen literatur: membaca PDF, menganalisis relevansi untuk Bab proposal, lalu me-rename PDF asli dan membuat file ekstraksi Markdown dengan nama yang identik dan berlabel Bab.
version: 2.0.0
platforms: [windows, macos, linux]
metadata:
hermes:
tags: [research, file-management, automation, literature-mapping]
category: productivity
requires_toolsets: [file_system, terminal]
config:
- key: research.naming_convention
description: "Format standar untuk sinkronisasi nama file PDF dan MD"
default: "[Label_Bab] - [YYYY] - [Penulis Utama] - [Judul Singkat]"
- key: research.output_dir
description: "Sub-folder untuk menyimpan hasil ekstraksi Markdown"
default: "/extracted_md"
---
# Auto Research Workflow & Synchronized Mapper
## When to Use
Gunakan skill ini saat pengguna memberikan direktori folder berisi file PDF referensi acak, beserta Judul Penelitian dan *Research Gap*. Skill ini akan membaca setiap paper, menentukan relevansinya (Bab 1, Bab 2, dst.), me-rename file PDF aslinya dengan label Bab, dan menghasilkan file Markdown berekstensi sama persis untuk memudahkan pelacakan.
## Procedure
1. **Pre-flight Check:**
- Pindai direktori folder menggunakan `file_system`. Buat sub-folder `/extracted_md`.
2. **Read & Analyze (Ekstraksi & Penentuan Bab):**
- Baca PDF. Evaluasi paper terhadap Judul dan Gap pengguna.
- Tentukan label [B1], [B2], atau [B3].
3. **Synchronized Renaming:**
- Rename file PDF asli dengan format `[Label] - [YYYY] - [Penulis] - [Short Title].pdf`.
- Buat file `.md` dengan nama dasar yang sama persis.
4. **Deep Section-by-Section Extraction:**
- JANGAN merangkum teks. Ekstrak informasi secara komprehensif bagian demi bagian ke dalam file `.md`.
- **Latar Belakang & Urgensi:** Ekstrak argumen utama penulis secara utuh (kutip kalimat penting).
- **Tinjauan Pustaka:** Daftar semua algoritma/metode SOTA yang dibandingkan oleh penulis.
- **Metodologi (Sangat Detail):** Ekstrak secara penuh langkah-langkah penelitian, parameter, arsitektur sistem, dan rumus/matematika yang digunakan. Jangan ada yang dipotong.
- **Hasil & Pembahasan:** Ekstrak metrik evaluasi secara lengkap beserta angka-angkanya (masukkan ke dalam format tabel Markdown jika memungkinkan).
- **Kelemahan & Future Work:** Salin teks asli dari bagian kesimpulan yang membahas batasan penelitian.
5. **Relevance Analysis:**
- Tulis analisis mendalam mengapa paper ini diberi label [B1]/[B2]/[B3] berdasarkan kecocokannya dengan judul dan gap milik pengguna.
## Pitfalls
- **Gagal Rename karena PDF Sedang Terbuka:** Jika pengguna sedang membuka PDF di aplikasi lain, proses rename akan gagal. *Fix:* Beri peringatan di log, lewati file tersebut, dan lanjutkan.
- **Nama File Terlalu Panjang:** Sistem operasi memiliki batas karakter untuk nama file. *Fix:* Batasi `[Short Title]` maksimal 5-6 kata saja saat memformulasikan nama file.
- **Kesalahan Klasifikasi Label:** Agen salah memberi label (misal paper SOTA dilabeli B1). *Fix:* Pastikan agen fokus pada *keyword* perbandingan metode untuk B2, dan urgensi makro untuk B1.
## Verification
- Cek folder utama: File PDF yang tadinya bernama acak kini sudah memiliki awalan `[B1]`, `[B2]`, dll., beserta Tahun dan Penulis.
- Cek folder `/extracted_md`: Terdapat file `.md` dengan nama yang **sama persis** dengan PDF aslinya.Prompt Lanjutan: Analisis State-of-the-Art (SOTA)
Setelah Hermes Agent berhasil mengekstraksi seluruh paper ke dalam folder /extracted_md menggunakan skill di atas, Anda dapat menggunakan prompt lanjutan di bawah ini. Prompt ini berfungsi untuk menginstruksikan Hermes Agent memindai hasil ekstraksi dan menyusun dokumen analisis SOTA (State-of-the-Art) serta matriks perbandingan secara komprehensif.
Hermes, aktifkan mode Asisten Peneliti Akademis. Lakukan pemindaian mendalam terhadap seluruh file Markdown di dalam folder /extracted_md. Identifikasi secara mandiri paper mana yang membahas urgensi masalah dan paper mana yang membahas pengujian metode/algoritma.
Buatkan dokumen 'SOTA_Analisis.md' yang komprehensif dengan struktur berikut:
1. Urgensi & Fenomena Masalah
(Sintesiskan 2-3 paragraf mengenai seberapa gawat dan mendesaknya masalah ini di lapangan berdasarkan temuan dari paper-paper yang relevan. Gunakan data atau metrik kegagalan jika tersedia di dalam teks ekstraksi).
2. Matriks Perbandingan State-of-the-Art (SOTA)
(Saring paper-paper yang menggunakan metode/algoritma alternatif untuk mencoba menyelesaikan masalah yang sama. Buat tabel Markdown dengan kolom: [Tahun] | [Penulis Utama] | [Metode/Algoritma Alternatif] | [Hasil Evaluasi] | [Kelemahan/Batasan]. Pastikan isi kolom 'Kelemahan' disalin langsung dari argumen batasan penelitian yang ditulis oleh penulis asli).
3. Sintesis Kesenjangan (Gap Synthesis)
(Tuliskan analisis yang menghubungkan poin 1 dan poin 2. Jelaskan benang merah mengapa masalah makro tersebut selama ini gagal diselesaikan secara optimal karena metode-metode alternatif memiliki pola kelemahan yang berulang, misalnya: kurang akurat, komputasi berat, tidak efisien, dll).
4. Justifikasi Kebaruan
(Buat satu paragraf penutup yang argumentatif dan kuat. Jelaskan secara logis mengapa metode baru yang saya ajukan di judul '[MASUKKAN JUDUL]' adalah terobosan pertama yang paling rasional dan superior untuk menutup semua kelemahan dari metode-metode alternatif di atas)


